DNA提取方法简介
DNA提取的几种方法
?基因组DNA的提取
?CTAB法
?SDS法
?其它
DNA提取的几种方法
?非基因组DNA的提取
?质粒DNA的提取
?碱裂解法
?煮沸法
?线粒体、叶绿体DNA的提取
?差速离心结合SDS裂解法
基因组DNA-CTAB法
?CTAB法原理(植物DNA提取经典方法)
?CTAB(hexadecyltrimethylammoniumbromide,十六烷基三甲基
溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,并与核酸形成复合
物。
?具有从低离子强度的溶液中沉淀核酸和酸性多聚糖的特性,在这种条
件下,蛋白质和中性多聚糖仍留在溶液里
?该复合物在高盐溶液中(0.7mol/LNaCl)是可溶的,通过有机溶剂
抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离
出来。
注:CTAB溶液在低于15℃时会形成沉淀析出,因此在将其加入冰冷的
植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。
基因组DNA-CTAB法
?CTAB提取缓冲液的经典配方
Tris-HClEDTA
组份NaClCTABβ-巯基乙醇
(pH8.0)(pH8.0)
0.1%(V/V)
终浓度100mM20mM1.4M2%(W/V)
使用前加入
?Tris-HCl(pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
?EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
?NaCl提供一个高盐环境,使DNP(脱氧核糖核蛋白)。CTAB溶解细胞膜,
并结合核酸,使核酸便于分离;
?β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除
基因组DNA-CTAB法
?CTAB提取缓冲液的改进配方
Tris-HClEDTA
组份NaClCTABPVP40β-巯基乙醇
(pH8.0)(pH8.0)
2%(V/V)
终浓度100mM20mM1.4M3%(W/V)5%(W/V)
使用前加入
?PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶
的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能
和多糖结合,有效去除多糖。
PVP(聚乙烯吡咯烷酮)
?PVP按其平均分子量大小分为四级,习惯上常以
K值表示,不同的K值分别代表相应的PVP平均分
子量范围。K值实际上是与PVP水溶液的相对粘度
有关的特征值,而粘度又是与高聚物分子量有关的
物理量,因此可以用K值来表征PVP的平均分子量。
通常K值越大,其粘度越大,粘接性越强。
?
?在研磨过程中加入PVP,其中的CO-N=基有很强的
结合多酚的能力,从源头上减少了酚类被氧化的机
会。
?同时向抽提液中加入还原剂β-巯基乙醇,后者能打
断多酚氧化酶中的二硫键,使多酚不易被氧化,随
后经抽提而去除。
基因组DNA-CTAB法
?CTAB法流程图
植物材料裂