关于总RNA的提取电泳鉴定及RTPCR第1页,共31页,星期日,2025年,2月5日实验一.提取小鼠肝脏组织的RNA第2页,共31页,星期日,2025年,2月5日一、真核细胞的总RNA1、mRNA:1-5%5`鸟嘌呤7位甲基化—CH3修饰。1)免受核酸酶破坏,2)起始、促进蛋白质合成。3`poly(A)尾巴结构20--200个A.翻译所必需。起始密码:AUG终止密码:UAA,UAG,UGA。2、tRNA:10-15%3、rRNA:80-85%大亚基60S:28S=4718nt5S=120nt5.8S=160nt小亚基40S:18S=1874nt第3页,共31页,星期日,2025年,2月5日二、RNA提取的注意事项RNA酶:广泛存在:灰尘、人体唾液、实验器材表面。生物活性非常稳定:耐热、耐酸、耐碱。1、尽量避免外源性RNase污染A.操作环境空气洁净。带手套、口罩。B.用新开封的化学试剂。(试剂应该专用)C.一次性塑料器材最好是新开封,(DEPC水处理后)高压灭菌。D.玻璃器材、水都应该经过去RNase处理。对玻璃器材还应该进行高温烘烤。2、抑制内源性RNase活性:RNase抑制剂。RNA分离的关键因素:避免RNA酶的污染。第4页,共31页,星期日,2025年,2月5日1)发放口罩,帽子,每个组来一个人领取。将1mLTrizol试剂移入Eppendorf管中。2)实验教师操作:取新鲜小鼠肝脏组织,组织块不宜过大,放在玻片上立即研磨,研磨要彻底。3)将研磨后的组织(小米粒大小)转移至1mLTrizol试剂中,盖紧盖,上下颠倒混合2min以上。
使组织细胞充分裂解。肉眼观察可见液体变成均匀浑浊状。4)室温孵育10min。三、RNA提取的实验操作播放有声课件1:RNA提取方法及注意事项第5页,共31页,星期日,2025年,2月5日1、异硫氰酸胍法:GuSCN是一种强的蛋白质变性剂,能够裂解细胞的同时,还能有效地抑制内源性Rnase的活性,通过有机溶剂的分步抽提,可获得纯度较高的细胞总RNA。特点:需低温操作,但价格经济。2、Trizol试剂(商品化产品)特点:在室温下可以提取细胞总RNA,简单、快速、提取量大、纯度高。3、mRNA提取试剂盒真核细胞mRNA的3末端有ploy(A)尾,利用寡聚dT纤维素结合mRNA,将其从细胞总RNA中分离出来。RNA提取的几种方法室温孵育10min介绍第6页,共31页,星期日,2025年,2月5日RNase抑制剂1、DEPC(二乙基焦炭酸盐)最常用的RNase抑制剂:与蛋白质中的组氨酸结合,使蛋白质变性。有效浓度:0.05%---0.1%(DEPC水),室温磁力搅拌20分钟。用于浸泡各种器材。灭活条件:高压。在Tris溶液中半衰期为1.25min。试剂的配制:无RNase的溶液(用DEPC水配制,高压)储存方法:不能用聚苯乙烯器皿。4?C,或液氮中。2、肝素:使用浓度:0.1—10mg/ml效果:37?C时,可抑制95%的RNase