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文件名称:第九章 动物基因组学基础(二)课件.ppt
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更新时间:2025-06-02
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文档摘要

动物遗传学-基因组水平的遗传?序列测定方法全基因组鸟枪法:在一定作图信息基础上,绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序,利用超级计算机进行组装(美国Celera公司)。人类基因组计划的意义基因组大小的比较(2)基因组大小的比较(1)动物遗传学-基因组水平的遗传第九章动物基因组学基础(二)动物遗传学-基因组水平的遗传主要内容第一节基因组及基因组学第二节基因组的序列组织第三节人类基因组计划第四节DNA分子标记第五节染色体外基因组第六节基因组印记第一节基因组及基因组学(GenomeandGenomics)动物遗传学-基因组水平的遗传GenomeandGenomics概念Genome=Gene+Chromesome一个配子中染色体遗传物质的总和;细菌或噬菌体:单个染色体所含的全部DNA分子或遗传信息二倍体生物:维持配子或配字体正常功能的最基本的一套染色体DNA及其遗传信息。动物遗传学-基因组水平的遗传C值矛盾C值:基因组的大小通常以一个基因组中的DNA含量来表示,成为生物体的C值(CValue)。动物遗传学-基因组水平的遗传⑶基因组的基因数目表3-3不同生物的基因数目动物遗传学-基因组水平的遗传基因组1%编码蛋白,99%垃圾序列动物遗传学-基因组水平的遗传非结构基因的DNA序列的结构与功能?C值矛盾匝生物学功能和进化中的意义?基因组学结构基因组学功能基因组学对基因组物理结构的作图和测序的研究应用整体的研究技术阐明这些基因和蛋白的生物学功能动物遗传学-基因组水平的遗传基因组学研究的发展基因组学(genomics)转录组学(transcriptomics)蛋白质组学(proteomics)表型组学(phenomics)系统生物学(SystemBiology)基因型+环境=表型动物遗传学-基因组水平的遗传第二节基因组的序列组织基因组的复杂性C值矛盾的解释:基因数量是否随着C值的增加而增加复性动力学C值的差异主要反映了重复序列DNA含量的差异动物遗传学-基因组水平的遗传基因的结构基因组的结构同一个基因能产生不止一个蛋白分子内含子/外显子动物遗传学-基因组水平的遗传单一序列(uniquesequence)又称非重复序列,在一个基因组中只有一个或几个拷贝DNA的序列。重复序列(repetitivesequence)重复序列的特点①重复单位的长度多样性,短的仅几个甚至两个核苷酸,长的有几百乃至上千个核苷酸。②重复的次数多样性,少的可重复几十次,多的上百万次。单一序列(uniquesequence)真核生物DNA的分类动物遗传学-基因组水平的遗传短分散重复序列(shortinterspersedrepeatedsequence,SINES)Alu家族(Alufamily)长分散重复序列(longinterspersedrepeatedsequence,LINES)KpnⅠ家族(KpnⅠfamily)①中度重复序列动物遗传学-基因组水平的遗传②高度重复序列卫星DNA由重复单位长度为2-200bp的重复序列组成。动物遗传学-基因组水平的遗传Ⅰ卫星DNA:由长的串联重复序列组成。Ⅲ微卫星DNA(microsatellite):以2-6个核苷酸为核心序列的串联重复序列。Ⅱ小卫星DNA(minisatellite):以6-25个核苷酸为核心序列的串联重复序列。动物遗传学-基因组水平的遗传基因家族(genefamily)是真核生物基因组中来源相同,结构相似,功能相关的一组基因。基因家族与基因簇动物遗传学-基因组水平的遗传成簇存在的基因家族基因簇(genecluster)是指基因家族的各成员紧密成簇排列成大段的串联重复单位,定位于染色体的特殊区域,它们是同一个祖先基因扩增的产物(MHCclassI)。Orphon—孤独基因动物遗传学-基因组水平的遗传HLAgenefamily动物遗传学-基因组水平的遗传Immunoglobulingenefamily动物遗传学-基因组水平的遗传Figure10.Theorganizationoftheimmunoglobulinheavychainlocusinvertebr