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文件名称:评价遗传多样性的统计方法.ppt
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总页数:43 页
更新时间:2025-06-13
总字数:约4.2千字
文档摘要

例如:吴伟、王栋等利用4个微卫星标记IDVGA-l1、IDVGA-27、IDVGA-44、IDVGA-46分析了5个品种、种群的遗传结构,其多态信息含量:南阳牛:0.6569,延边牛:0.5742,韩牛:0.5317,西门塔尔牛:0.6491,杂种牛:0.6869。杂种牛变异最大,韩牛变异最小,南阳牛变异较大。第30页,共43页,星期日,2025年,2月5日(4)有效等位基因数(Effectivenumberofalleles,Ne)有效等位基因数是反映群体遗传变异大小的一个指标,其数值越接近所检测到的等位基因的绝对数,表明等位基因在群体中分布越均匀。1、群体内基因多样性Pi为第i个有效等位基因的频率第31页,共43页,星期日,2025年,2月5日评价遗传多样性的统计方法第1页,共43页,星期日,2025年,2月5日一、评价动物遗传多样性的意义第2页,共43页,星期日,2025年,2月5日第一、动物的遗传多样性大小是长期进化的产物,是其生存适应和发展进化的前提。遗传多样性越高或遗传变异越丰富,动物对环境变化的适应能力就越强遗传变异的大小与其进化速率成正比对遗传多样性的研究有助于探讨动物物种稀有或濒危原因及过程1、评价动物遗传多样性的意义第3页,共43页,星期日,2025年,2月5日第二、遗传多样性是保护动物研究的核心之一不了解种内遗传变异的大小、时空分布及其与环境条件的关系,我们就无法采取科学有效的措施来保护人类赖以生存的动物遗传资源基因,来挽救濒于绝灭的动物,保护受到威胁的动物。1、评价遗传多样性的意义第4页,共43页,星期日,2025年,2月5日第三、对遗传多样性的认识是动物各分支学科重要的背景资料。对遗传多样性的研究无疑有助于人们更清楚地认识动物多样性的起源和进化,尤其能加深人们对微观进化的认识,为动物的分类进化研究提供有益的资料,进而为动物育种和遗传改良奠定基础。1、评价遗传多样性的意义第5页,共43页,星期日,2025年,2月5日世界上动物遗传资源保存存在着两种倾向:⑴在多数发达国家里,随着畜牧生产体系的集约化,大量饲养的只是少数经济价值高的品种和杂交种,品种数目迅速减少;⑵在一些发展中国家,虽然有较丰富的遗传资源,但由于保种不当和盲目引进外来品种杂交,使原有的地方品种数量大大减少,这两种倾向都导致世界性的动物遗传资源危机。2、评价动物遗传多样性的必要性第6页,共43页,星期日,2025年,2月5日联合国发表的若干动物建少情况2、评价动物遗传多样性的必要性第7页,共43页,星期日,2025年,2月5日重要解决手段----开展动物品种的保存和开发利用评价遗传多样性动物遗传资源的危机2、评价动物遗传多样性的必要性第8页,共43页,星期日,2025年,2月5日二、动物遗传多样性的研究方法第9页,共43页,星期日,2025年,2月5日1、遗传多样性检测方法本质:揭示遗传物质的变异方法:从形态学水平、细胞学(染色体)水平、生理生化水平、逐渐发展到分子水平。具体方法:传统的形态学、细胞学以及同工酶和DNA技术第10页,共43页,星期日,2025年,2月5日(1)PCR特异扩增ITS序列目前鉴定物种和做分子分类研究的最主流的方法.2、遗传多样性研究方法第11页,共43页,星期日,2025年,2月5日PCR特异扩增ITS序列的原理:ITS序列是中度重复序列,广泛分布于基因组并且是同步进化的,而且不同物种间进化差异很大,它的碱基序列同源性的程度决定生物之间的亲源关系远近,并可以以此来作为分类依据划分物种.ITS序列在核糖体大小亚基的rRNA之间,核糖体大小亚基的rRNA序列非常保守,便于设计PCR过程所需的两端特异性引物,进行典型的锚定PCR.2、遗传多样性研究方法第12页,共43页,星期日,2025年,2月5日(2)差异显示PCR可以用来研究同一个体不同生长时段和不同组织(或分化结构)或者不同个体之间基因表达差异.2、遗传多样性研究方法第13页,共43页,星期日,2025年,2月5日差异显示PCR原理是根据中心法则,每一个阅读框要表达必须先转录成mRNA.那么在不同细胞内只要存在基因差异表达现象,肯定就会存在不同的mRNA.我们可以提取细胞的mRNA,然后将其反转录为cDNA,并以此来作为PCR模板,通过PCR就可以显示并放大出mRNA的差异,从而找到差异表达的基因.2、遗传多样性研究方法第14页,共43页,星期日,2025年,2月5日(3)RFLP(扩增片段长度多样性)基于RF