基于“神威·太湖之光”的分子动力学算法优化与性能提升研究

一、引言

1.1研究背景与意义

在科学研究和工程应用的广袤领域中，分子动力学算法作为一种强大的计算模拟工具，正发挥着愈发关键的作用。从微观层面揭示物质的原子和分子结构，到阐释复杂的化学反应机理，再到探究材料的力学性能，分子动力学模拟为众多科学问题的研究提供了独特视角与有力手段。在药物研发领域，分子动力学模拟可用于深入探究药物分子与靶标蛋白的相互作用，从而助力优化药物结构，加速新药研发进程。在材料科学领域，它能够模拟材料在不同条件下的微观结构演变，为新材料的设计与性能优化提供重要依据。

神威?太湖之光作为我国自主研发的超级计算机，自诞生