借助重叠肽确定肽段次序：末端残基HS末端肽段HOWTAPS（OUS）第一套肽段HOWTOUSEOVERLAPS第二套肽段HOWTOUSEOVERLAPS推断全顺序HOWTOUSEOVERLAPS氨基末端残基H羧基末端残基S第一套肽段第二套肽段OUSSEOPSWTOUEOVEVERLRLAAPSHOWTHO举例：所得资料第59页，共98页，星期日，2025年，2月5日核酸推导法原理：蛋白质的氨基酸顺序是由核酸的核苷酸顺序决定的。测出核酸的核苷酸顺序根据三个核苷酸确定一个氨基酸的密码子推导出蛋白质的氨基酸顺序第60页，共98页，星期日，2025年，2月5日小结掌握：片段重叠法确定肽段在多肽链中顺序；熟记：组成蛋白质的各种氨基酸以及缩写符号；熟悉：分析多肽链的N-末端和C-末端残基的方法；第61页，共98页，星期日，2025年，2月5日蛋白质分子的构象又称空间结构、立体结构、高级结构、三维构象等，是指蛋白质分子中原子和基团在三维空间上的排列、分布及肽链的走向。蛋白质的分子构象取决于一级结构，是蛋白质生物学功能或活性所必需的。蛋白质的构象可分为二、三、四级结构。蛋白质的二级结构第62页，共98页，星期日，2025年，2月5日蛋白质的二级结构定义是指肽链的主链骨架中若干肽单位，各自沿一定的轴盘旋或折叠形成的有规则的构象，以氢键为主要的次级键。蛋白质的二级结构中不涉及氨基酸残基侧链的构象。主链：是由氨基酸的羧基与氨基形成的肽键部分规则的重复排列而成。侧链：R基部分。第63页，共98页，星期日，2025年，2月5日两肽键平面的交接点为α-碳以肽键为平面连接成多肽长链注意：α-碳上面接有各种大小不等的基团第64页，共98页，星期日，2025年，2月5日肽单位（peptideunit）：肽键与相邻的两个Cα组成的基团其中肽键具有部分双键性质，不能自由旋转。肽单位是刚性平面，其上面6个原子处于同一平面，称为肽平面。肽链主链上只有两个α碳原子连接单键可旋转。肽单位中与C-N相连的氢和氧原子与两个α碳原子呈反向分布。第65页，共98页，星期日，2025年，2月5日肽链中的肽平面第66页，共98页，星期日，2025年，2月5日蛋白质空间结构单元β-折叠(β-pleatedsheet)β-转角(β-turn)环(loop)无规则卷曲（randomcoil）Ribbonmodelofthebacterialcatabolitegeneactivatorprotein(CAP)α-螺旋(α-helix)肽键平面对多肽链构象的限制第67页，共98页，星期日，2025年，2月5日肽平面的相叠形成α螺旋第68页，共98页，星期日，2025年，2月5日?-螺旋(?-helix)指蛋白质分子中多个肽平面通过氨基酸?-碳原子的旋转，使多肽链的主骨架沿中心轴盘曲成稳定的?-螺旋构象。第69页，共98页，星期日，2025年，2月5日1.物理性质形态：均为白色结晶或粉末，不同氨基酸的晶型结构不同。溶解性：一般都溶于水，不溶或微溶于醇，不溶于丙酮，在稀酸和稀碱中溶解性好。熔点：氨基酸的熔点一般都比较高，一般都大于200℃，超过熔点以上氨基酸分解产生胺和二氧化碳。旋光性：除甘氨酸外都有旋光性，左旋用（-）表示，右旋用（+）表示。氨基酸的旋光性和大小取决于R基的性质，并且与D/L型没有直接的对应关系。氨基酸的性质第27页，共98页，星期日，2025年，2月5日2.化学性质氨基酸的两性解离与等电点氨基酸是两性电解质，其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。等电点（isoeletricpoint，PI）：当溶液浓度为某一pH值时，氨基酸分子中所含的-NH3+和-COO-数目正好相等，成为兼性离子，净电荷为0，呈电中