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文档摘要

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我正在负责2025年国家传染病预防控制中心的重点项目分子溯源与传播链分析，这个项目主要运用4分子流行病学技术对今年3月发生在广东省深圳市龙岗区的聚集性新冠肺炎病例进行溯源研究。我们团队通过对128例确诊病例的病毒样本进行全基因组测序，发现这些病毒株之间存在高度同源性（99.7%），其中例（占比67.2%）属于同一传播链。这些病例主要集中在龙岗中心医院周边3公里范围内的5个社区，涉及3个工厂和2所学校。目前我们已经建立了详细的分子进化树，并确定了可能的超级传播事件发生在2月28日某工厂的员工聚餐活动中。

在实际操作中，我们发现传统的流行病学调查方法难以准确追踪病毒传播路径。为此，我们采用了高通量