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摘要

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蛋白质是细胞功能的执行者，预测蛋白质的功能有助于研发新药物、探索发

病机制和揭示生物体的运作过程。随着基因组学的快速发展，已知蛋白质序列的

数量激增，而对蛋白质功能的测定却进展缓慢。基于实验注释蛋白质功能的方法，

因效率低、成本高的局限性，无法实现快速且大规模的功能预测。基于机器学习

和深度学习的计算方法为蛋白质功能预测提供了新的解决方案。蛋白质分类预

测和蛋白质-适配体相互作用预测是蛋白质功能预测的两个重