系统发育树构建时最优模型筛选（MrModeltest2-master）教程

系统发育树构建之前需要我们尽可能根据核酸序列文件选择最优的核苷酸替代模型（注：不

同模型对拓扑结构的影响不是很大，而当在计算时间节点或使用对枝长敏感的算法时模型的

选择和预设很重要。）本教程提供使用MrModeltest2-master程序估算建树序列文件的最优模

型的详细教程，以用于PAUP和MrBayes建树。

该教程分为三部分

第一部分是：建树序列文件准备。

1.下载建树所用的核酸序列

2.将这些序列整理到一个fasta文件中，序列标签名中不能有特殊符号，如“