基于MapReduce的BLAST序列比对算法并行化：原理、实现与优化

一、引言

1.1研究背景

随着生命科学和计算机科学的飞速发展，生物信息学作为一门交叉学科应运而生，并在过去几十年中取得了巨大的进步。生物信息学利用计算机技术和数学算法对生物数据进行存储、管理、分析和解释，旨在揭示生物分子的结构、功能和进化规律，为生命科学研究提供重要的支持。

在生物信息学的众多研究领域中，序列比对是一项基础而关键的技术，对于理解生物分子（如DNA、RNA和蛋白质）的结构和功能具有重要意义。通过将两个或多个生物序列进行对齐和比较，可以发现它们之间的相似性和差异，进而推断序列的保守区域、功能位点以及物种之