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乳腺癌化疗耐药性相关生物标志物的筛选与验证
目录
TOC\o1-3\h\u1绪论 1
1.1研究背景及意义 1
1.2国内外研究进展 1
2材料与方法 5
2.1GDSC数据库 5
2.1.1细胞系表达谱数据集 5
2.1.2药物反应数据集 5
2.2SPEED2数据库和富集分析 6
2.2.1Bates检验 6
2.2.2Chi2检验 6
2.3癌症化疗药物 7
2.3.1ACS中癌症化疗药物 7
2.3.2GDSC中抗癌化疗药物 7
2.3.3乳腺癌化疗药物筛选 8
2.4样本筛选 9
2.4.1对于显著药物的处理方法 9
2.4.2对于相对显著药物的处理方法 10
2.5表达数据预处理 10
2.6差异表达基因筛选 11
2.7生物通路富集分析 11
3实验结果 12
3.1基于SPEED2的生物通路富集分析 12
3.2抗癌药物挖掘 19
4结论与讨论 20
参考文献 21
1绪论
1.1研究背景及意义
肿瘤异质性是指肿瘤在生长过程中，经过多次分裂增殖，其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变，从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异ADDINEN.CITEEndNoteCiteAuthor卞修武/AuthorYear2018/YearRecNum1/RecNumDisplayTextstyleface=superscript[1]/style/DisplayTextrecordrec-number1/rec-numberforeign-keyskeyapp=ENdb-id=efrrv9xs2xt02zevx0055pzleeerz2rvdw0etimestamp=16529178981/key/foreign-keysref-typename=ConferenceProceedings10/ref-typecontributorsauthorsauthor卞修武/author/authors/contributorstitlestitle肿瘤干细胞:肿瘤异质性的来源与精准医学的挑战/titlesecondary-title中国生物化学与分子生物学会全国会员代表大会暨全国学术会议/secondary-title/titlesdatesyear2018/year/datesurls/urls/record/Cite/EndNote[1]，继而对化疗药物产生耐药和治疗的失败，是肿瘤治疗的挑战所在（萧景明，孟雨萱，2022）。耐药是异质性的其中一种表型，异质性耐药是指细菌的不同亚群对某种抗菌药物表现出不同的敏感性，由此可以窥其全貌但大部分亚群属于敏感，只有一小部分亚群属于耐药（薛昊然，陶若曦，2024）。细菌一旦出现异质性耐药，在抗菌药物选择性压力下，即使是小部分的耐药亚群也可表现出高水平的表型耐药，而这部分耐药亚群会导致应用抗菌药物抗感染治疗的失败ADDINEN.CITEEndNoteCiteAuthor侯琦/AuthorYear2003/YearRecNum2/RecNumDisplayTextstyleface=superscript[2]/style/DisplayTextrecordrec-number2/rec-numberforeign-keyskeyapp=ENdb-id=efrrv9xs2xt02zevx0055pzleeerz2rvdw0etimestamp=16529180842/key/foreign-keysref-typename=JournalArticle17/ref-typecontributorsauthorsauthor侯琦/authorauthor马筱玲/author/authors/contributorstitlestitle细菌的异质性耐药/titlesecondary-title临床输血与检验/secondary-title/titlesperiodicalfull-title临床输血与检验/full-title/periodicalpages238-240/pagesvolume5/volumenumber003/numberdatesyear2003/year/datesurls/urls/record/Cite/EndNote[2]。
乳腺癌是一种复杂的异质性疾病，是危害女性健康的最常见的恶性肿瘤ADDINEN.CITEEndNoteCiteAuthor白鸽综述/AuthorYear2011/Yea