基本信息
文件名称:ThermoFishe cfTNA Panel 验证方案学习.pptx
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总页数:15 页
更新时间:2024-12-14
总字数:约1.17万字
文档摘要

OncomineLungCell-FreeTotalNucleic

AcidResearchAssay验证分析

1描述

OncomineLungcfTNA检测从全血血浆组分中分离的肺癌肿瘤来源无细胞DNA和RNA(无细胞总

核酸;cfTNA)。其提供了文库构建试剂,以及用于从单管10mL全血的血浆组分中获得的cfTNA

制备扩增子文库的多重PCR引物池。

1.优势

1

侵入性较小,可在多个时间点采集样品以监测癌症进展

?

成本较低

?

从样品到结果的周转时间更短

?

更好地表示肿瘤异质性

?

检测类型

1.

2热点基因和短插入缺失:、、、、、、、

?(SNV)ALKBRAFEGFRERBB2KRASMAP2K1MET

NRAS、PIK3CA、

ROS1和TP53(覆盖~168个热点)

基因融合:、、

?ALKRETROS1

外显子跳跃

?MET14

拷贝数基因:

?(CNV)MET

检测下限

1.

3

20ngcfDNA起始量下:

对于短插入缺失,可实现为、灵敏度为、特异性

?SNV/LOD0.1%~90%99%

对于融合和外显子跳读,可实现为、灵敏度为、特异性

?METLOD1%90%99%

对于靶标,可实现检测低至倍扩增、灵敏度为、特异性

?METCNV1.290%99%

分析方法

2

整个工作流程,从使用MagMAX无细胞总核酸分离试剂盒分离cfTNA到样品分析,可使用

IonS5XL测序系统在两天内完成。

实验流程

2.

1