基本信息
文件名称:ThermoFishe cfTNA Panel 验证方案学习.pptx
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总页数:15 页
更新时间:2024-12-14
总字数:约1.17万字
文档摘要
OncomineLungCell-FreeTotalNucleic
AcidResearchAssay验证分析
1描述
OncomineLungcfTNA检测从全血血浆组分中分离的肺癌肿瘤来源无细胞DNA和RNA(无细胞总
核酸;cfTNA)。其提供了文库构建试剂,以及用于从单管10mL全血的血浆组分中获得的cfTNA
制备扩增子文库的多重PCR引物池。
1.优势
1
侵入性较小,可在多个时间点采集样品以监测癌症进展
?
成本较低
?
从样品到结果的周转时间更短
?
更好地表示肿瘤异质性
?
检测类型
1.
2热点基因和短插入缺失:、、、、、、、
?(SNV)ALKBRAFEGFRERBB2KRASMAP2K1MET
NRAS、PIK3CA、
ROS1和TP53(覆盖~168个热点)
基因融合:、、
?ALKRETROS1
外显子跳跃
?MET14
拷贝数基因:
?(CNV)MET
检测下限
1.
3
20ngcfDNA起始量下:
对于短插入缺失,可实现为、灵敏度为、特异性
?SNV/LOD0.1%~90%99%
对于融合和外显子跳读,可实现为、灵敏度为、特异性
?METLOD1%90%99%
对于靶标,可实现检测低至倍扩增、灵敏度为、特异性
?METCNV1.290%99%
分析方法
2
整个工作流程,从使用MagMAX无细胞总核酸分离试剂盒分离cfTNA到样品分析,可使用
IonS5XL测序系统在两天内完成。
实验流程
2.
1